O 3º Batalhão de Polícia de Choque, inicialmente denominado de Batalhão de Operações Especiais (3º BOE), foi criado através do Decreto nº 43.763 assinado em 25 de abril de 2005, pelo Exmo. Sr. Governador Estado da época, Germano Rigotto, em razão da grande demanda de Operações Especializadas na metade norte do Estado do Rio Grande do Sul.
Foi instalado em 17 de maio de 2005, na sede do antigo Quartel do Exército Brasileiro, na Rua Teixeira Soares no Centro de Passo Fundo, onde permanece sediado até hoje.
Seu batismo de fogo, logo em seguida a sua instalação, no ano de 2006, foi a Rebelião no Presídio Regional de Passo Fundo, que na época contava com mais de 500 presos, somente terminando com a entrada e intervenção do efetivo do 3º BOE.
Em 20 de dezembro de 2018, conforme o Decreto Estadual nº 54.424 o 3º Batalhão de Operações Especiais passa a ter a denominação atual de 3º Batalhão de Polícia de Choque (3ºBPChq).
O 3º BPChoque comemora seu 16º aniversário, com muito trabalho, Força, Honra e Lealdade.